BIDS Manager : gestion des données neuroscientifiques
Le projet BIDS Manager est une initiative collaborative qui réunit l’ICM (Institut du Cerveau, CNRS, AP-HP, Inserm, Sorbonne Université) et l’équipe CeZaMe du laboratoire Neuroscience Paris Seine - IBPS (CNRS, Inserm, Sorbonne Université). Il est mené par deux chercheuses dans le domaine des neurosciences, Anne Lise Paradis de Neuroscience Paris Seine et Katia Lehongre de l’ICM. Le projet implique également SACADO et deux ingénieurs de SUMMIT, Téo Lohrer et Alix Letheinturier, tous deux du département technique Ingénieries et Systèmes (DTIS).
Les neurosciences sont un domaine qui génère une vaste quantité de données aux formats hétérogènes. Chaque laboratoire utilise souvent ses propres méthodes de rangement et d'organisation des données, ce qui complique l'échange, la vérification et l'exploitation des informations. Ce manque de standardisation constitue un obstacle majeur à l’interopérabilité entre logiciels et au partage de données, compliquant aussi la pérennité des données, un aspect crucial dans une recherche souvent menée sur le long terme.
Pour remédier à ces défis, un standard a été défini : le BIDS (Brain Imaging Data Structure). Ce format de données a été conçu pour faciliter l'exploitation et l'organisation des données neuroscientifiques, en harmonisant leur structure et en permettant un échange plus simple et fiable entre les chercheurs. Il fournit un cadre structuré pour la conversion des données, les standardisant afin de les rendre compatibles avec différents systèmes de traitement.
BIDS Manager vise à simplifier l’utilisation en proposant une application web qui permettra de convertir automatiquement les données neuroscientifiques au format BIDS. Développée par SUMMIT, cette application permettra aux chercheurs de gérer leurs données de manière simple et rapide, sans nécessiter de manipulations techniques complexes. SACADO joue également un rôle important en mettant à disposition des moyens de calcul performants et de stockage pour le projet.
L’objectif est de fournir une plateforme flexible, sécurisée et efficace pour le traitement des données, garantissant une interopérabilité totale entre les laboratoires et les logiciels utilisés. Ainsi, les chercheurs seront mieux équipés pour gérer les vastes quantités de données produites lors des études neuroscientifiques.
Cette initiative se positionne comme un outil essentiel pour la recherche en neurosciences, facilitant la standardisation et le partage des données tout en respectant les besoins spécifiques de chaque équipe scientifique. En contribuant à la gestion des données, elle améliore également les pratiques collaboratives en recherche scientifique.